無菌實驗室內部裝飾、消毒要求都很嚴格：

▼ 無菌實驗室應每次使用前后用0.1%苯扎溴銨溶液或2%甲醛液擦拭工作臺面及可能污染的死角，濕拖地面，打開無菌空氣過濾器及超凈工作臺的開關30分鐘，紫外線殺菌燈照射1小時。

▼ 操作人員用肥皂洗手后進入緩沖間換拖鞋，用75%酒精棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。將所需物品剝去牛皮紙及外包裝，從傳遞窗移入操作間，再用0.1%苯扎溴銨溶液泡手后進入操作間，在酒精(或煤氣燈)火焰區(火焰高度3-5cm)操作。

▼ 操作者不得用嘴直接吸吹吸管，防止致病菌感染操作人員及口中的雜菌污染供試品。

▼ 供試品表面消毒，如為安瓿先用砂輪劃痕后用2%碘酒棉球擦拭，再用75%酒精棉球擦拭、待干，也可以用消毒液浸泡消毒。

▼ 注射器如需回抽時，應對著火焰吸入無菌空氣。

▼ 在無菌操作中切勿大幅度或快速動作、拖行，以免攪動空氣中塵埃微粒。

▼ 所用的器材如培養基、稀釋劑配制后經121℃濕熱滅菌30分鐘，吸管培養皿等均應洗滌，干燥，包扎后經160℃干熱滅菌2小時才能使用。

▼ 無菌實驗室一般設置在微生物實驗室內，室內室外裝備的換氣設備須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環境和無菌材料后，只有保持無菌狀態，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩定性是無菌室的核心驗收指標。業內通行的驗收標準為100級潔凈區平板雜菌數平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，在通行標準之外，還應該定期保養與維護。只有建設時合理的選材指標，合適凈化等級和長期管理與維護，才能使無菌實驗室發揮其應有的作用。